绿豆Trihelix基因家族的鉴定及表达特征分析

摘要：Trihelix转录因子是一种植物特异性转录因子，在植物种子形成、花的发育、光调节等生长过程及抗逆响应中均发挥着重要作用。为了探讨Trihelix转录因子在绿豆（Vigna radiata）生长发育及胁迫过程中的作用，本研究采用生物信息学方法从绿豆基因组数据库中筛选出38个Trihelix（VrGT）家族成员，不均匀地分布在1-10号染色体上，分为5个亚家族，同一个亚家族成员的保守基序类型和数量较相似，且含有特定的保守基序；大多数基因含有1-2个内含子；片段重复是VrGT基因家族扩张的主要驱动力；分别有12和30个VrGT基因与拟南芥（Arabidopsis thaliana）和大豆（Glycine max）基因组存在种间共线性；上游2000bp启动子区域预测到多个与生长发育、光响应、激素响应及胁迫响应等相关的顺式作用元件；WRKY、MYB、bHLH等多个转录因子家族与VrGT基因共表达；38个VrGT基因在绿豆不同生育期、不同组织器官中及不同的非生物胁迫下的表达存在显著差异，其中在萌发的种子中表达量最高，有4个基因在绿豆生长发育过程中具有高表达量，有3个基因在干旱胁迫早期和晚期的地上部或根系一直具有较高的响应水平，有8个基因对盐碱胁迫具有明显的调控作用。本研究为进一步解析VrGT基因家族的生物学功能提供了参考。

关键词：绿豆; Trihelix转录因子; 干旱胁迫; 盐碱胁迫; 表达特征分析